En un día como hoy, pero de 2020 se conocían los dos primeros casos de Covid-19 en el departamento, los dos de Armenia. La primera muerte se dio en poco menos de un mes después, el 9 de abril. Una mujer de 79 años de edad en el municipio de Montenegro. Para este tiempo ya el número de casos iba cada vez más en ascenso. El 8 de enero de este año se conoció el mayor número de muertes en un solo día a causa del virus.
Al día de hoy, el departamento suma 31.115 contagiados y 1008 fallecidos por Coronavirus. El municipio con el mayor número de casos es Armenia con y 645 muertes. Buenavista, que además es el único que presenta baja afectación es el que menor número de víctimas mortales cuenta con 2. También es el que menos infectados tiene, 81.
Frente al número de vacunados, vale destacar que el Quindío se encuentra en el puesto 13 de 37 distritos y departamentos en los que está dividido el país para la distribución de las vacunas, con un 67.6 % de avance en el sistema de vacunación respecto a las dosis entregadas.