El Instituto Nacional de Salud y la Secretaria Departamental de Salud del Cauca participan en la investigación de la Agencia de Desarrollo Internacional de los Estados Unidos de América con la que se estudia la eficacia de métodos para la prevención de la malaria en este departamento. Desde el Gobierno Nacional y las entidades territoriales se desarrollan acciones encaminadas a brindar una respuesta integral tendiente a fortalecer la detección, diagnóstico, tratamiento y respuesta oportuna a los casos.
Así como estrategias de promoción y prevención, dentro de las cuales está la instalación de toldillos impregnados con el fin de proteger a las personas residentes en áreas de riesgo durante sus horas de descanso.